Unternehmensarchitekturen verbessern das Verständnis der betrieblichen Strukturen und Abläufe sowie der informationstechnischen Voraussetzungen eines Unternehmens. Jedes erfolgreiche Unternehmen hat eine Aufbau- und Ablauforganisation mit darin eingebundenen IT-Lösungen zur Unterstützung der geschäftlichen Ziele, die man auch als „Architektur“ des Unternehmens betrachten kann. Solche Unternehmensarchitekturen können erfasst und visualisiert werden, um als Grundlage für Planungen und Entscheidungen zu dienen. Der Lehrstuhl Wirtschaftsinformatik erforscht nicht nur Methoden, Praktiken und Werkzeuge zum Management von Unternehmensarchitekturen, sondern auch die Entwicklung von Referenz-Architekturen für Anwendungsgebiete und Branchen.

Es gibt unterschiedliche Ansätze zum Aufbau einer Unternehmensarchitektur, die sich im Wesentlichen durch die Zusammensetzung der einzelnen Architekturebenen unterscheiden. Grundsätzlich besteht eine Unternehmensarchitektur aus den drei Architekturebenen Geschäfts-, Informationssystem- und Technologie- Architektur.

Unternehmensarchitekturen erleichtern im Allgemeinen das Verständnis und die Weiterentwicklung von Zielen, Strategien, Organisationsstrukturen, Prozessen, Verantwortlichkeiten, Ressourcen sowie deren Beziehungen untereinander. Die Unternehmensarchitektur für ein konkretes Unternehmen beschreibt in der Regel die aktuelle sowie die geplante, zukünftige Situation des Unternehmens, die beispielsweise bei der Einführung von Veränderungen entstehen soll. Eine zentrale Aufgabe besteht in der transparenten Darstellung, welche Veränderungen im Unternehmen welche Auswirkungen haben werden. Eine „digitale“ Unternehmensarchitektur ist dabei eine Unternehmensarchitektur für die Umsetzung digitaler Geschäftsmodelle oder die Unterstützung der digitalen Transformation.

Referenz-Architekturen haben generell das Ziel, die "typische" Unternehmensarchitektur in einem Anwendungsgebiet oder einer Branche herauszuarbeiten bzw. eine Empfehlung bereitzustellen, wie die Unternehmensarchitektur aussehen sollte. Dabei sind in der Regel alle Architekturebenen definiert, sodass Referenz-Architekturen auch typische Organisationsstrukturen, Geschäftsprozesse, Anwendungslandschaften oder Informationsflüsse beinhalten. Der Lehrstuhl Wirtschaftsinformatik hat u.a. auf Referenz-Architekturen für IT-gestützte Compliance in der Finanzindustrie und für mittelgroße Energieversorger konzentriert.